2014年起，上海以放权与监管为核心，实施高等教育投入机制改革，加强经费综合监督管理。

一、以“三个转变”为目标推动高等教育投入机制改革

为进一步激活高校改革发展活力，进一步激发高校内涵建设动力，上海以国家和上海市中长期教育改革和发展规划纲要为导向，促进实现“三个转变”，即：从专项投入为主向经常性投入为主转变、从分散投入为主向学校整体投入为主转变、从硬件投入为主向软件投入为主转变。

采取“经常性经费投入”加“市级统筹投入”的方式，努力做到“三个打通”，即打通生均公用经费与经常性专项经费、打通“十大工程”专项经费与地方高等教育内涵建设相关的经费、打通用于教师队伍建设的经费。

通过建立“三个机制”，即：建立“以基本办学经费和内涵建设经费为主的经常性投入机制”“以教育改革发展重大项目为导向的市级统筹投入机制”和“以提高教育项目支出效益为目标的综合监督评估机制”，全面深化高等教育投入机制改革。

二、以放权为核心扩大高校基本办学经费自主权

一是改变投入方式。建立以基本办学经费和内涵建设经费为主的经常性经费投入机制，地方高校部门预算由“基本办学经费”和“地方高校内涵建设经费”两个部分组成，增加对高校内涵建设经常性投入。

二是改变管理模式。针对上海地方高校经常性投入的经费，更加注重高校安排经费的统筹能力，加强经费使用监督；针对上海市级统筹的专项经费，从注重立项管理转向注重过程管理，从注重项目管理转向注重学校管理，从注重分配管理转向注重绩效管理。

三是改变投入结构。据统计，上海市级财政高等教育经费投入中，2012年经常性经费投入约占30%，2014年已达到66%。上海将通过逐年过渡，使高校经常性投入达到70%以上，进一步扩大高校经费使用自主权，提升高校自主办学能力。

三、以监管为核心健全高校经费使用监督管理机制

一是建立高等教育投入评估咨询机制。充分发挥各方智慧，适应本市高等教育综合改革发展的现实需要，建立评估咨询专家库，健全和完善高等教育投入体制机制，进一步促进高等教育投入的决策民主化和科学化。

二是推行市属公办高校总会计师制度。为加强上海地方公办高校财务管理工作，提升教育经费使用和资产管理的专业化水平，印发《上海市地方公办高等学校总会计师管理办法（试行）》，明确上海公办高校实行总会计师委派制度，针对学校有重大影响的经济活动，实行总会计师和学校校（院）长共同签署和审批制度，赋予总会计师参与学校重大财务决策的权力，发挥财务管理的专业能力，从内控管理上防范学校财务风险。

三是健全高校经费综合监督管理机制。为适应高等教育投入机制改革的新趋势，上海市教委相继出台了“地方高校内涵建设经常性经费使用指导意见”“进一步完善高等教育投入机制的若干意见”“事业单位国有资产管理实施总则”以及固定资产管理、无形资产管理、库存物资管理、出租出借管理、委托经营管理、房地产登记管理实施细则等系列配套制度。同时明确高校经费监管组织机构，建立健全市属高校财务信息化管理系统，实行地方高校经费使用情况绩效评价和考核制度，试行地方高校财务管理状况评价等。