办公室（人事处）

负责具体落实上级党组织工作部署，做好党建日常工作；负责统战、群团等工作；负责公文运转、机要收发、档案、信息、安全、保密、信访、后勤保障等日常工作，负责对外联络；承担单位干部人事相关工作；负责退休人员服务管理工作。

财务处

严格贯彻执行国家法律法规、政策文件和财务管理制度，确保各项财务收支的合法、合规；围绕单位事业发展需要，做好财务管理与服务、监督与筹划工作；负责单位预决算管理、内部控制和国有资产管理等工作；承办直属高校和直属单位国有资产处置备案初审工作。

综合监管处

负责制订单位发展规划，开展教育经费监管相关研究，编写经费监管报告，开展单位内部审计监督等工作；承办教育部内部审计相关的辅助性工作、大额资金监控等有关工作。

机关与直属单位处

负责承办教育部机关各司局和直属单位内部控制建设核查、预算评估评审、预算绩效管理等有关工作和其他与财务管理相关的专项调研、检查、咨询服务等工作；承担直属单位财务共享平台管理与运行工作。

直属高校处

负责承办教育部直属高校内部控制建设核查、预算评估评审、预算绩效管理、中央高校捐赠收入财政配比核查等有关工作和其他与财务管理相关的专项调研、检查、咨询服务等工作。

地方处

负责承办中央对地方教育转移支付资金预算评估评审、预算绩效管理等有关工作和其他与财务管理相关的专项调研、检查、咨询服务等工作。

信息处

负责承担教育财务信息化平台建设、中国教育经济信息网管理与运行、教育财务数据分析应用、教育财务网络舆情监测等工作；负责单位网络安全及信息化建设管理工作。

培训处

负责承办教育系统财会、审计、资产管理人员业务培训和继续教育工作,承办培训师资队伍和培训课程建设工作；承担教育系统财务干部网络学习平台建设管理与运行工作。